РТС «Балтийская», как и все районные тепловые станции Калининграда, работает на природном газе. Однако, согласно нормам энергетической безопасности, имеет в активе и запас резервного топлива (мазут).
Испытания по переходу теплостанций на жидкое топливо проходят ежегодно. Они позволяют проверить резервные системы и убедиться, что в случае перебоев с газом, переход на мазут произойдёт максимально оперативно, и жизнедеятельность стратегических тепловых источников не будет нарушена. Возможное изменение цвета дыма связано с подбором оптимального режима горения топлива.
РТС «Балтийская» обеспечивает теплом и горячей водой 125 жилых домов, 26 социальных объектов и 32 промышленных здания в южной части города.